Dentro del Mapa de Grupos de Investigación de la Universitat Rovira i Virgili , el Grupo de Investigación Autoecologia Humana del Quaternari desarrolla cuatro proyectos del Plan Nacional de Investigación Científica, Desarrollo e Innovación Tecnológica 2004-2007 que agrupan las principales líneas de investigación del instituto. Además este Grupo es uno de los Grupos de investigación consolidados reconocidos en el Plan de Investigación e Innovación (Pla de recerca i innovació, PRI) de la Generalitat de Catalunya.

Proyectos de Investigación del Plan Nacional, Gobierno de España

• “Dinámica de Ecosistemas terrestres en el Plio-Pleistoceno de las cuencas del Levante español”. IP: Jordi Agustí. 2006-2009. Ministerio de Educación y Ciencia, CGL2006-04548/BTE
• “Cambios tecno-culturales y de paisaje en la transición Pleistoceno - Holoceno en las zonas de influencia mediterránea de la Península Ibérica” IP: FRANCESC BURJACHS CASAS, 2007-2008, Ministerio de Educación y Ciencia HUM2007-62915/HIST
• "Comportamiento Ecosocial de los Homínidos de la Sierra de Atapuerca durante el Cuaternario" IP: Eudald Carbonell. De octubre 2006 a septiembre 2009. Ministerio de Educación y Ciencia CGL2006-13532-C03-01/BTE
• “Estudio de los grandes mamíferos continentales del Plio-Pleistoceno en el entorno de los homínidos: tafonomía, sistemática y paleoecología". IP: Bienvenido Martínez Navarro. Octubre 2006 a octubre 2009. Ministerio de Educación y Ciencia, CGL2006-13808-C02-01/BTE
• MEC HF2007-0122. (Acción Integrada de Investigación Científica y Tecnológica entre España y Francia). IP: Eudald Carbonell y Moncel Marie Hélène. Musém Nacional d’Histoire Naturelle. Paris, Francia (2008 - 2009). Secretaría General de Política Científica y Tecnológica. Dirección General de Investigación. Ministerio de Educación y Ciencia.

Proyecto del Pla de Recerca i Innovació, Generalitat de Catalunya

• SGR Generalitat de Catalunya: Autoecologia Humana del Quaternari. Grup de Recerca Consolidat (2005SGR Núm. expedient 00702). Direcció General de Recerca, Generalitat de Catalunya